医学院前身是四川省攀枝花卫生学校，始建于1972年12月，时称“四川省渡口卫生学校”。1998年8月1日，攀枝花卫生学校并入攀枝花大学，成立攀枝花大学医学系，同时保留四川省攀枝花卫生学校校名。2006年12月19日，医学系更名为医学院。

2000年招收首届临床医学专科学生。2003年获批护理学本科专业，2010年获批临床医学本科专业，截止至2016年底，医学院已开设临床医学和护理学2个全日制本科专业；临床医学、护理、助产、医学检验技术、眼视光技术和康复治疗技术6个全日制专科专业。

2017年9月护理、康复治疗技术和中专类专业划归攀枝花学院康养学院，医学院保留1个本科专业（临床医学），3个专科专业（临床医学、医学检验技术、眼视光技术）。